Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms