Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms