Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff2Q9QYM9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms