Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms