Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms