Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms