Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms