Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx12Q9ER00 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms