Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms