Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Riok3Q9DBU3 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms