Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms