Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Efhc1Q9D9T8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms