Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms