Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc52a3Q9D6X5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms