Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Necab3Q9D6J4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necab3Q9D6J4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms