Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfn4Q9D6I3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfn4Q9D6I3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms