Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447A16RikQ9D5F6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms