Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zc2hc1bQ9D534 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zc2hc1bQ9D534 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zc2hc1bQ9D534 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms