Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl3Q9D4V7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl3Q9D4V7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms