Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms