Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ribc2Q9D4Q1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms