Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1Q9D495 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms