Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms