Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.6 ms