Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raet1eQ9CZQ6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raet1eQ9CZQ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms