Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms