Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx7Q9CY18 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms