Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem175Q9CXY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem175Q9CXY1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms