Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms