Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx28Q9CWT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms