Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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