Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc5Q9CRA8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc5Q9CRA8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms