Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms