Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl35Q9CQL6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Mrpl35Q9CQL6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl35Q9CQL6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl35Q9CQL6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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