Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znhit3Q9CQK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms