Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DenrQ9CQJ6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DenrQ9CQJ6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms