Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt23Q99PS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms