Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4Q99P72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms