Protein–RNA interactions for Protein: Q99M85

Scrt1, Transcriptional repressor scratch 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scrt1Q99M85 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scrt1Q99M85 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scrt1Q99M85 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms