Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms