Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpifQ99KR7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms