Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg1Q925E1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms