Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms