Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms