Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms