Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfxn3Q91V61 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms