Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cul7Q8VE73 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms