Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Fam20bQ8VCS3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fam20bQ8VCS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms