Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms