Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ep400Q8CHI8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms